中藥材幹燥加工後，必須及時進行科學的包裝、貯藏、才能保持其藥效、質量和價值。否則，若包裝貯藏不當，使其出現蟲蛀、黴爛、變質、揮發、變味等現象。不僅失去藥效，而且服用後還會產生毒副作用。

1、含揮發油類藥材的貯藏 如細辛、川芎、白芷、玫瑰花、玳玳花、佛手花、月季花、木香、牛膝等多含揮發油，氣味濃郁芳香，色彩鮮艷，不宜長期暴露在空氣中。為此，此類藥材宜用雙層無毒塑膜袋包裝。袋中放少量生石灰或明礬、幹燥的鋸木屑、谷殼等物。紮緊後貯藏於幹燥、通風、避光處。

2、含糖類藥材的貯藏 如白芨、知母、枸杞子、玉竹、黃精、何首烏、地黃、天科、黨參、玄參等含糖類較高的藥材，易吸潮而糖化發粘，且不易幹燥，然後裝入雙層無黴的塑膜袋風包好紮緊，放在幹燥、通風而又密封的陶瓷缸、壇、罐內，再放些生石灰或明礬、幹燥且新鮮的鋸木屑、谷殼等物覆蓋防潮。

3、果實、種子類藥材的貯藏 如郁李仁、薏苡仁、柏子仁、杏仁、芡實、巴豆、木鱉子、蓮子肉等藥材多含澱粉、脂肪、糖類、蛋白質、等成分。若遇高溫則其油易外滲，使藥材表面出現油斑汙點，引起變質、酸敗和變味。為此，此類藥村不宜貯藏在高溫場所，更不宜用火烘烤，應放在陶瓷缸、壇、玻璃缸、瓶內或金屬桶等容器內、貯藏於陰涼、幹燥、避光處，可防蟲蛀和黴爛變質。

4、澱粉類藥材的貯藏 如明黨參、北沙參、何首烏、大黃、山藥（淮山）、葛根、澤瀉、貝母等多含澱粉、蛋白質、氨基酸等多種成分。為此，宜用雙層無黴塑膜袋包裝紮緊後放在裝有石灰或明礬、幹燥鋸木屑、谷殼等物的容器內貯藏，可防蟲蛀、回潮、變質、黴爛。